全民奇迹2中有许多隐藏任务设计巧妙且富有探索乐趣，这些任务通常需要满足特定条件或在地图特定位置触发。其中较为经典的包括缜密头脑真假故事仁慈之心再生宝石等，每个任务都附带独特剧情和丰厚奖励。隐藏任务普遍要求玩家达到1转80级或100级部分甚至需2转100级才能解锁，建议优先提升角色等级以扩大可探索范围。
缜密头脑任务位于奇迹大陆墓园，需对指定墓碑连续祭拜9次才能触发灵魂NPC，随后需破解建筑谜题寻找三个线索：船长右侧的旋转圆球桌、紫色珊瑚下的机关等。该任务考验逻辑推理能力，最终奖励为记载建筑学知识的珍贵笔记。真假故事则要求玩家在亚特兰蒂斯海域寻找漂流瓶，与流浪商人海洛德互动时需要辨别故事真伪，任务标注了真实故事虚构故事两种类型，虚构内容仅为增强趣味性不会影响奖励获取。
冰封峡谷区域集中了多个特色隐藏任务，失踪的货物需破坏不同颜色机关解救运送员；炼金与魔法则需在冰湖村落与塞尔维斯对话触发炼金术研究剧情。精灵之森地图的尤达的请求任务存在双重触发机制，除雕像旁的尤达外，找到隐藏NPC小加布还能解锁额外任务链，需注意必须手动跟随足迹不能使用自动寻路功能。
高等级隐藏任务如2转100级的再生宝石，需在幽暗密林找到奥斯博接取，任务涉及从四个改造魔物中识别真正的吉瑞敦，需根据对话气泡和爱好提示选择正确答案。仁慈之心任务在奇迹大陆与安娅互动后，需要完成系列善行事件，最终奖励包含特殊称号和稀有材料。部分任务如异地恋人存在多结局设定，不同选择将影响剧情走向但不会降低奖励品质。
探索隐藏任务时建议优先查看NPC对话中的关键词提示，部分任务如临时研究员需要与特定职业NPC格格杜反复互动才能触发。游戏设计者在地图边缘、水域底部等非主线区域设置了大量隐藏触发点，保持细致观察和耐心探索是发现这些任务的关键。完成任务后获得的特殊道具和笔记往往包含后续任务的线索，建议妥善保留相关物品。
